Aufgrund seiner Erkrankung an Kinderlähmung war Hermann Müller-Karpe vom Militärdiienst befreit, meldete sich aber aus Gewissensgründen freiwillig. Seine Einberufung erfolgte zu einer Panzerfunkerabteilung nach Weimar. Dort erfolgte seine Ausbildung zum Fernsprecher, dann zum Funker. Mit seiner Einheit gelangte er im März nach Eisenach, wo kurze Zeit später in Kriegsgefangenschaft geriet.

Im März geriet er in Eisenach in amerikanische Kriegsgefangenschaft. Er wurde in ein amerikanisches Gefangenalger in Senay an der Maas transportiert. Im August wurde er aus der Gefangenschaft entlassen.